Владимир Иванович Истомин родился 19 марта 1809 г. в дворянской семье судебного секретаря, все пятеро сыновей которого посвятили себя морскому делу.
В 1823-1827 гг. Истомин обучался в Морском кадетском корпусе. Во время Русско-турецкой войны 1828-1829 гг. служил на линейном корабле "Азов" под командой М.П. Лазарева, участвовал в Наваринском сражении (1827 г.), за которое получил орден св. Георгия, и в блокаде Дарданелл, где подружился с В.А. Корниловым и П.С. Нахимовым,.
В 1830 г. вернулся в Кронштадт, служил на Балтике. В 1835 г. был переведен на Черное море; командовал шхуной, пароходом, корветом, фрегатом. Участвовал в Кавказской войне в 1847 г. В 1850 г. Истомину, капитану первого ранга, поручили командовать новейшим 120-пушечным линейным кораблем «Париж», на котором он отличился в Синопском сражении (1853 г.). Истомин, по рапорту Нахимова, «проявил примерную неустрашимость и твердость духа, благоразумные, искусные и быстрые распоряжения во время боя» и был произведен в контр-адмиралы.
С началом обороны Севастополя возглавил один из важнейших участков оборонительной линии —4-ю дистанцию, включавшую Малахов курган и прилегающие редуты. 7 марта был убит во время артиллерийского обстрела.