Реставрационная мастерская ЦВММ является уникальным центром реставрации моделей кораблей. Аналогов ей в нашей стране нет. Реставрационная мастерская появилась в военно-морском музее еще в середине XIX века. За почти полторы сотни лет у реставраторов музея накопился немалый опыт. В музейной мастерской реставрируют модели кораблей, ткани, живопись. Ежегодно через руки ее специалистов проходит не менее пятидесяти музейных предметов. Работа в мастерской осуществляется непрерывно.
ЦВММ организует реставрационные и ремонтно-восстановительныеработы по сохранению и консервации, по возвращению экспозиционного облика музейным предметам, хранящмся в фондах и размещенным в экспозициях музея, включая его филиалы.