Музей Черноморского флота города Севастополя дает представление обо всех этапах развития Черноморского флота — с момента его основания в 1783 году и до сегодняшнего дня. Этот музей вошел в состав ЦВММ, став седьмым по счету филиалом, 31 декабря 2020 года.
Начало музею Черноморского флота положил Севастопольский музей, основанный в 1869 году. Инициаторами создания экспозиции были участники 349-дневной обороны Севастополя в Крымской войне 1855–1856 годов при покровительстве императора Александра II.
За более чем 150 лет своего существования музей собрал множество экспонатов, посвященных Черноморскому флоту. Среди них личные вещи В. А. Корнилова и П. С. Нахимова — руководителей первой обороны Севастополя 1854–1855 годов; фотографии, личные вещи, документы руководителей и участников второй героической обороны Севастополя 1941–1942 годов; картины известных художников; модели надводных кораблей, подводных лодок и самолетов военного и послевоенного периодов, а также экспонаты, повествующие о маневрах, учениях и повседневной работе по боевой подготовке моряков Черноморского флота.
Сегодня Музей Черноморского флота входит в число самых популярных достопримечательностей Севастополя и Крыма.